MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitratifractor salsuginis DSM 16511 chromosome

Total Repeats: 43146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014935	AC	3	6	77	82	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014935	ATC	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319955761
3	NC_014935	TCCC	2	8	154	161	0 %	25 %	0 %	75 %	319955761
4	NC_014935	CGC	2	6	251	256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319955761
5	NC_014935	GCA	2	6	268	273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955761
6	NC_014935	AGG	2	6	344	349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955761
7	NC_014935	TCG	2	6	448	453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319955761
8	NC_014935	CCAA	2	8	460	467	50 %	0 %	0 %	50 %	319955761
9	NC_014935	CAA	2	6	638	643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319955761
10	NC_014935	CGA	2	6	719	724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955761
11	NC_014935	AGA	2	6	748	753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319955761
12	NC_014935	C	6	6	827	832	0 %	0 %	0 %	100 %	319955761
13	NC_014935	C	6	6	903	908	0 %	0 %	0 %	100 %	319955761
14	NC_014935	CAT	2	6	929	934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319955761
15	NC_014935	AAG	2	6	939	944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319955761
16	NC_014935	ATC	2	6	978	983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319955761
17	NC_014935	CGA	2	6	1145	1150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955761
18	NC_014935	A	6	6	1206	1211	100 %	0 %	0 %	0 %	319955761
19	NC_014935	CGT	2	6	1223	1228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319955761
20	NC_014935	ACG	2	6	1235	1240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955761
21	NC_014935	CCG	2	6	1321	1326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319955761
22	NC_014935	TGA	2	6	1367	1372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319955761
23	NC_014935	TCC	2	6	1384	1389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319955761
24	NC_014935	CGA	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955761
25	NC_014935	A	8	8	1438	1445	100 %	0 %	0 %	0 %	319955761
26	NC_014935	A	7	7	1485	1491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014935	CTA	2	6	1560	1565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014935	ATCGA	2	10	1623	1632	40 %	20 %	20 %	20 %	319955762
29	NC_014935	TCA	2	6	1636	1641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319955762
30	NC_014935	GAA	2	6	1661	1666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319955762
31	NC_014935	GCCA	2	8	1671	1678	25 %	0 %	25 %	50 %	319955762
32	NC_014935	ATC	2	6	1827	1832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319955762
33	NC_014935	TGA	2	6	1882	1887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319955762
34	NC_014935	CAG	2	6	1893	1898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955762
35	NC_014935	CCT	2	6	1942	1947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319955762
36	NC_014935	TC	4	8	1975	1982	0 %	50 %	0 %	50 %	319955762
37	NC_014935	A	7	7	2010	2016	100 %	0 %	0 %	0 %	319955762
38	NC_014935	CAA	2	6	2036	2041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319955762
39	NC_014935	TGG	2	6	2098	2103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319955762
40	NC_014935	CCA	2	6	2131	2136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319955762
41	NC_014935	CAA	2	6	2141	2146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319955762
42	NC_014935	TCC	2	6	2170	2175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319955762
43	NC_014935	A	6	6	2178	2183	100 %	0 %	0 %	0 %	319955762
44	NC_014935	ACG	2	6	2233	2238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955762
45	NC_014935	ATC	2	6	2250	2255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319955762
46	NC_014935	ACG	2	6	2260	2265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955762
47	NC_014935	TCA	2	6	2287	2292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319955762
48	NC_014935	A	6	6	2358	2363	100 %	0 %	0 %	0 %	319955762
49	NC_014935	ACC	2	6	2391	2396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319955762
50	NC_014935	CGA	2	6	2456	2461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955762
51	NC_014935	TC	4	8	2521	2528	0 %	50 %	0 %	50 %	319955762
52	NC_014935	TCT	2	6	2540	2545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319955762
53	NC_014935	ATC	2	6	2640	2645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319955762
54	NC_014935	TAT	2	6	2651	2656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319955762
55	NC_014935	CAA	2	6	2686	2691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319955763
56	NC_014935	AT	3	6	2700	2705	50 %	50 %	0 %	0 %	319955763
57	NC_014935	CTC	2	6	2770	2775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319955763
58	NC_014935	GACC	2	8	2892	2899	25 %	0 %	25 %	50 %	319955763
59	NC_014935	CAA	2	6	2949	2954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319955763
60	NC_014935	CAC	2	6	2958	2963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319955763
61	NC_014935	GGT	2	6	3030	3035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319955763
62	NC_014935	TCG	2	6	3044	3049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319955763
63	NC_014935	CCG	2	6	3069	3074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319955763
64	NC_014935	ACC	2	6	3118	3123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319955763
65	NC_014935	GCA	2	6	3185	3190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955763
66	NC_014935	TGA	2	6	3194	3199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319955763
67	NC_014935	CCT	2	6	3213	3218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319955763
68	NC_014935	GCG	2	6	3232	3237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319955763
69	NC_014935	GCG	2	6	3282	3287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319955763
70	NC_014935	C	6	6	3299	3304	0 %	0 %	0 %	100 %	319955763
71	NC_014935	GAA	2	6	3348	3353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319955763
72	NC_014935	CTAT	2	8	3416	3423	25 %	50 %	0 %	25 %	319955763
73	NC_014935	AGC	2	6	3473	3478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955763
74	NC_014935	GGAT	2	8	3503	3510	25 %	25 %	50 %	0 %	319955763
75	NC_014935	GCA	2	6	3528	3533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955763
76	NC_014935	CGA	2	6	3549	3554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955763
77	NC_014935	TCG	2	6	3734	3739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319955763
78	NC_014935	AG	3	6	3796	3801	50 %	0 %	50 %	0 %	319955763
79	NC_014935	AGA	2	6	3803	3808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319955763
80	NC_014935	CGA	2	6	3903	3908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955763
81	NC_014935	ACC	2	6	3982	3987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319955763
82	NC_014935	G	6	6	3997	4002	0 %	0 %	100 %	0 %	319955763
83	NC_014935	GGA	2	6	4053	4058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955763
84	NC_014935	AGC	2	6	4127	4132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955763
85	NC_014935	TTG	2	6	4280	4285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319955763
86	NC_014935	AGC	2	6	4298	4303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955763
87	NC_014935	GCT	2	6	4358	4363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319955764
88	NC_014935	GA	3	6	4364	4369	50 %	0 %	50 %	0 %	319955764
89	NC_014935	CGA	2	6	4376	4381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955764
90	NC_014935	GCGG	2	8	4436	4443	0 %	0 %	75 %	25 %	319955764
91	NC_014935	GCG	2	6	4535	4540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319955764
92	NC_014935	TTC	2	6	4542	4547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319955764
93	NC_014935	CGC	2	6	4673	4678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319955764
94	NC_014935	GCG	2	6	4686	4691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319955764
95	NC_014935	GATC	2	8	4712	4719	25 %	25 %	25 %	25 %	319955764
96	NC_014935	ACC	2	6	4732	4737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319955764
97	NC_014935	CGC	2	6	4756	4761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319955764
98	NC_014935	CCG	2	6	4862	4867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319955764
99	NC_014935	GGGC	2	8	4873	4880	0 %	0 %	75 %	25 %	319955764
100	NC_014935	ATC	2	6	4920	4925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319955764
101	NC_014935	GCA	2	6	4943	4948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955764
102	NC_014935	CCT	2	6	4982	4987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319955764
103	NC_014935	GGAGC	2	10	4988	4997	20 %	0 %	60 %	20 %	319955764
104	NC_014935	TCG	2	6	5011	5016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319955764
105	NC_014935	GGA	2	6	5105	5110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955764
106	NC_014935	AGG	2	6	5152	5157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955764
107	NC_014935	AACG	2	8	5190	5197	50 %	0 %	25 %	25 %	319955764
108	NC_014935	AGG	2	6	5227	5232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955764
109	NC_014935	GATC	2	8	5243	5250	25 %	25 %	25 %	25 %	319955764
110	NC_014935	TCG	2	6	5308	5313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319955764
111	NC_014935	CG	3	6	5315	5320	0 %	0 %	50 %	50 %	319955764
112	NC_014935	CCT	2	6	5371	5376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319955764
113	NC_014935	CGGA	2	8	5387	5394	25 %	0 %	50 %	25 %	319955764
114	NC_014935	GTGA	2	8	5487	5494	25 %	25 %	50 %	0 %	319955764
115	NC_014935	AGC	2	6	5515	5520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955764
116	NC_014935	GCA	2	6	5726	5731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955764
117	NC_014935	AGG	2	6	5767	5772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955764
118	NC_014935	GATCG	2	10	5811	5820	20 %	20 %	40 %	20 %	319955764
119	NC_014935	AAG	2	6	5941	5946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014935	TAA	2	6	5959	5964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014935	ATA	2	6	5984	5989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014935	A	7	7	6025	6031	100 %	0 %	0 %	0 %	319955765
123	NC_014935	CAG	2	6	6078	6083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955765
124	NC_014935	A	6	6	6107	6112	100 %	0 %	0 %	0 %	319955765
125	NC_014935	C	6	6	6123	6128	0 %	0 %	0 %	100 %	319955765
126	NC_014935	TTG	2	6	6195	6200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319955765
127	NC_014935	TCG	2	6	6228	6233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319955765
128	NC_014935	AT	3	6	6271	6276	50 %	50 %	0 %	0 %	319955765
129	NC_014935	ACT	2	6	6279	6284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319955765
130	NC_014935	GAC	2	6	6295	6300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955765
131	NC_014935	AAG	2	6	6302	6307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319955765
132	NC_014935	AAG	3	9	6311	6319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319955765
133	NC_014935	TGA	2	6	6358	6363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319955765
134	NC_014935	GCAA	2	8	6443	6450	50 %	0 %	25 %	25 %	319955765
135	NC_014935	A	6	6	6470	6475	100 %	0 %	0 %	0 %	319955765
136	NC_014935	GTC	2	6	6485	6490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319955765
137	NC_014935	CGC	2	6	6530	6535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319955765
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139	NC_014935	TCT	2	6	6594	6599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319955765
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141	NC_014935	ATAA	2	8	6712	6719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014935	CT	3	6	6733	6738	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014935	TCTT	2	8	6775	6782	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014935	GA	3	6	6859	6864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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248	NC_014935	A	6	6	12723	12728	100 %	0 %	0 %	0 %	319955771
249	NC_014935	A	6	6	12741	12746	100 %	0 %	0 %	0 %	319955771
250	NC_014935	CTT	2	6	12763	12768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_014935	ATA	2	6	12828	12833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_014935	GAA	2	6	12850	12855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
253	NC_014935	TGAG	2	8	12859	12866	25 %	25 %	50 %	0 %	319955772
254	NC_014935	AGG	2	6	13030	13035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955772
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261	NC_014935	AGG	2	6	13195	13200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319955772
262	NC_014935	AGC	2	6	13245	13250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319955772
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397	NC_014935	G	6	6	19542	19547	0 %	0 %	100 %	0 %	319955778
398	NC_014935	CAGG	2	8	19562	19569	25 %	0 %	50 %	25 %	319955778
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496	NC_014935	TGGAT	2	10	24142	24151	20 %	40 %	40 %	0 %	319955783
497	NC_014935	GGC	2	6	24173	24178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319955783
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